Пролин часто находится в конце α-спирали или в витках или петлях. В отличие от других аминокислот, которые существуют почти исключительно в трансформе в полипептидах, пролин может существовать в цис-конфигурации в пептидах.
Содержат ли альфа-спирали остатки пролина?
Теперь, когда в Protein Data Bank насчитывается более 30 000 белковых структур, становится ясно, что остатки пролина присутствуют в α-спиралях, где они часто играют важную роль. в структуре и функции белка.
Какие аминокислоты входят в состав альфа-спиралей?
Любая из 20 аминокислот может участвовать в α-спирали, но некоторые из них более предпочтительны, чем другие. Ala, Glu, Leu и Met чаще всего встречаются в спиралях, тогда как Gly, Tyr, Ser и Pro встречаются реже.
Содержат ли бета-листы пролин?
Пролин не рекомендуется в структурах бета-листов, поскольку он не может завершить сеть Н-связей. Когда пролин действительно встречается в листах, он может быть в выпуклости или краю листа, где отсутствие донора водородной амино-связи не является критическим.
Что содержит альфа-спирали?
Альфа-спираль (α-спираль) является общим мотивом во вторичной структуре белков и представляет собой конформацию правой спирали, в которой каждая водородная группа N−H основной цепи связывается с основной цепью C=O. группа аминокислоты, расположенная четырьмя остатками ранее по последовательности белка.
